曙光官微发布《先进计算“精准医疗”领域三大趋势》

HPC升级,云计算首选,可控共享基因数据库

北京,2019年7月10日/美通社/ - 健康是所有人的追求。随着基于“个人”基因,病史和其他大数据分析的技术进步,“精确医疗”正成为各国医学界的新探索。方向。

最近,中科曙光在其官方微观上发布了《先进计算“精准医疗”领域三大趋势》(以下简称“趋势”),“趋势”指出:1。对HPC(高性能计算机)的精准医疗需求将随着大量遗传数据和复杂。组学分析过程全面升级; 2.云计算将成为“精确医疗”的首选方案; 3.不同的研究机构将共同建立一个可控的共享遗传数据库。

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中科曙光关卫

云计算将成为“精准医疗”的首选场景

自2015年美国总统巴拉克奥巴马提出“精准医疗计划”以来,包括中国在内的十几个国家提出了相关计划。 2016年,中国科技部首次举办“全国精准医疗战略专家会议”。计划到2030年投资600亿元推动“精准医疗”的发展。“精准医疗”离不开先进计算的支持。

《先进计算“精准医疗”领域三大趋势》指出,随着基因测试和“精确医疗”的组学分析等技术的发展,为“先进计算”平台提出了更高的性能和兼容性要求。

例如,用于“精密医疗”第三代基因测序,组学分析等大规模,小规模,一次性提交数百种应用数据处理要求的技术,以及各种基因检测和特征分析软件共存,快速更新迭代无需统一标准,HPC将全面升级,采用PB(十亿字节)级存储架构,解决数据复杂的过程分析功能,并适应软件的多样性和变化。

目前,“个人”基因测序的成本已降至数百美元,但个体的“遗传谱”怎样才能获得系统的“精确医学”测试,而且该行业还没有完善工业模型。但是,谷歌和微软已经开始通过云计算提供“基因云”等服务,因此首先通过“云计算”实现更多“精确医疗”方案。

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《先进计算“精准医疗”领域三大趋势》

此外,随着基因测序的普及,“精准医疗”产业链中的不同研究机构将在受控条件下交换和共享遗传数据,以提高其在相关领域的研发能力和效率,并建立可控的共享。基因数据库。

曙光为60多家医疗机构提供“高级计算”解决方案

为响应这种“趋势”,中科曙光解决方案中心技术总监杨力表示,曙光很早就为医疗机构提供了“先进的计算”解决方案。在SARS期间,曙光4000超级计算机协助SARS的全基因组测序。

“'精确医学'的发展依赖于大量医疗数据信息的存储,分析和利用。如何快速分析复杂过程的数据并将海量数据转换为可用信息是精准医疗和挑战的难题对于先进的计算平台。“杨力说,目前,曙光有”北京大学医学院“和”四川人民医院“等12家三级医院,以及”崇南巴南医院“和”江苏泰州人民医院“。医院“和其他50家公司。综合医院,县医院,医疗机构等提供计算服务。

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曙光为60多家医疗机构提供“高级计算”解决方案

此外,曙光还与华大基因等“基因组学研究与开发机构”合作,推动基因测序产业的发展。此次发布的“趋势”基于曙光为大量客户提供的解决方案。

北京牧野基因技术有限公司首席信息技术架构和运维工程师王晓斌表示,目前的“基因测序”数据是“精准医疗”行业的基础,是中国投资最多的领域之一。行业。第二代和第三代“基因测序”软件,IO读写稳定性和计算平台带宽,以及CPU性能要求。

在审查了许多供应商之后,王晓斌及其同事根据数据读/写效率和计算稳定性考虑,购买了2018年上半年支持Infiniband网络的并行存储设备和四路服务器产品。

“从硬件到软件,曙光拥有完整的Infiniband架构并行存储解决方案,与'基因测序'软件的兼容性非常好,整个存储系统稳定了一年多。”王晓斌表示,今年他们将继续加大对存储和计算设备的投入,以满足业务增长需求。

目前,中科曙光在为基因组学,蛋白质组学,转录组和代谢组学的分析,储存,共享和精准医学相关研究提供“精确医学”综合“先进计算”平台方面拥有成熟的经验。通过硬件,软件和维护提供全面的支持服务,分析和解释大数据。

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